Метаболомика

    Метаболомика изучает конечные и промежуточные продукты обмена веществ в клетке. Метаболомный анализ в настоящее время рассматриваться как одно из самых перспективных направлений развития молекулярных методов в области системной биологии.
     Современная метаболомика далеко вышла за рамки рамки постгеномного анализа и оценки раннего фенотипического отклика. Биохимическое состояние системы, описываемое метаболитным профилем, вполне может выступать в роли альтернативного взгляда на биологический объект. Оценка устойчивости и динамики таких состояний может сопровождать практически любой биологический эксперимент, мониторинг или наблюдение. При этом полученные данные могут существенно помочь в понимании процессов, происходящих на молекулярном уровне и даже дать ключ к возможности реализации управления этими процессами. Залогом успеха применения подобного подхода является возможность одновременной качественной и количественной характеристики очень большого числа малых биомолекул в исследуемом образце (по некоторым оценкам среднее число компонентов метаболитной сети составляет более 5000 соединений). Метаболитный профайлинг может дать очень интересную информацию о состоянии и поведении сложных динамических систем, которыми, по сути, и являются биологические объекты. Для его успешной реализации необходима аналитическая техника высокого класса включая хроматоргафическое и масс-спектрометрическое оборудование, представленное в ресурсном центре.
Установленное оборудование для газовой хромато-масс-спектрометрии позволяет проводить анализ таких веществ, как:
  • сахара и их производные
  • аминокислоты
  • другие органические кислоты
  • гормоны растений (ауксин, салициловая кислота, этилен, абсцизовая кислота)
  • воски (сложные эфиры высших жирных кислот и высшие высокомолекулярные спирты) 
Устновленное оборудование для жидкостной хромато-масс-спектрометрии позволяет проводить анализ:
  • белков
  • пептидов ( пептидные гормоны, цитокины, тахикины)
  • глюкозинолатов
  • фенольных производных

Масс-спектрометрия

Газовый хромато-масс-спектрометр Leco Pegasus 4D 
Жидкостный хромато-масс-спектрометр с электроспрейной ионизацией (ESI) Agilent  6538 UHD
Масс-спектрометр с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (МАЛДИ, MALDI) Bruker Ultraflextreme

Хроматография 

Высокоэффективный жидкостный хроматограф (ВЭЖХ, HPLC) Agilent 1260
Газовый 2D хроматограф (GCxGC) Agilent 7890 в составе системы   Leco Pegasus 4D .

Оптическая спектрометрия

Оценка параметров фотосинтетической системы Walz PAM-2500
Сканирующий спектрофотометр/флуориметр Agilent Cary Eclipse


Смотрите также оборудование других ресурсных центров СПбГУ: