SVI Huygens Pro

Размещение: василеостровская площадка

Статус: эксплуатация в режиме тестирования

› Календарь занятости компьютера и ПО SVI Huygens

Основные технические характеристики

Позволяет проводить количественную деконволюцию изображений
Включает алгоритм измерения функций рассеивания (функция рассеивания точки, pointspread function, PSF).
Включает стандартный набор морфометрических инструментов анализа изображений (измерение первичных морфометрических характеристик: площади, периметра, основной и дополнительной осей объекта, и др.).

Доступно два варианта пакета Huygens professional и Huygens essential:

Huygens Professional

Вариант программного обеспечения, позволяющий производить тонкую настройку параметров деконволюции для одно- и многоканальных изображений.
Включает следующие опции:

1. Оптическая опция для конфокальной микроскопии.
Позволяет проводить обработку изображений с учетом внедренных метаданных. Позволяет проводить автоматическую коррекцию эффекта фотовыцветания препарата, автоматическую коррекцию фона, автоматическую коррекцию сферической аберрации. Использует из метаданных все необходимые параметры для деконволюции изображения с учётом диаметра конфокальной диафрагмы.
2. Оптическая опция для широкопольной и светлопольной микроскопии.
Позволяет учитывать параметры и особенности широкопольных снимков, тестирование и коррекцию мерцания, нестабильности ламп освещения. Позволяет проводить обработку изображений с учетом внедренных метаданных. Позволяет проводить автоматическую коррекцию эффекта фотовыцветания препарата, автоматическую коррекцию фона.
3. Оптическая опция для микроскопии с вращающимся диском.
Позволяет проводить обработку изображений с учетом внедренных метаданных.
4. Оптическая опция для мультифотонной микроскопии. Позволяет учитывать особенности и свойства снимков, полученных с помощью мультифотонной микроскопии, с учётом возможности получения изображения с недесканируемых детекторов и детекторов расположенных за конфокальной диафрагмой.
5. Программа для экспериментального получения функции рассеяния точки любого микроскопического оборудования и расчёта модели пригодной для использования при деконволюции изображений в остальных опциях PSF Distiller.
6. Опция для работы с временными рядами.
Позволяет просматривать и вырезать трехмерные фрагменты в 4-мерных стеках изображений. Предусматривает возможность использования метода объемной деконволюции с учетом коррекции мерцания для любых типов микроскопов. Содержит инструмент коррекции Z-дрейфа для конфокальных и мультифотонных серий изображений, коррекции изменений фона по оси времени, коррекции во времени: четырёхмерная (4D) Гауссова коррекция, коррекция Лапласа, коррекция по карте потока (Plot Flux).
7. Пакет анализа и визуализации:
7.1. Рендеринг (моделирование) поверхности;
7.2. Анализ колокализации по пикселям;
7.3. Анализ колокализации с учетом объектов;
7.4. Создание анимаций.
8. Стабилизатор объектов.
Позволяет осуществлять стабилизацию изображения для 2D и 3D временных серий, а также для срезов в 3D-сериях. Позволяет производить измерения и коррекцию смещения объектов на субпиксельном уровне.
9. Отслеживание объектов.
Инструмент, позволяющий осуществлять идентификацию объектов с использованием автоматического многоканального 2D и 3D отслеживания во времени. Включает возможность визуализации и количественной оценки перемещения объектов.
10. Опция чтения особых форматов файлов, включая Zeiss ZVI, Leica LIF, Olympus OIF, Zeiss LSM, Biovision IPL (Windows), Biovision IPM (Mac)и др.

Huygens Essential

Облегченный вариант программного обеспечения, предназначенный для обработки одно- и многоканальных изображений, включающий возможность деконволюции изображений, полученных на широкопольном, конфокальном, мулитифотонном микроскопи и микроскопе на основе диска Нипкова
Включает следующие опции:

1. Визуальный инструмент Twin Slicer, позволяющий осуществлять одновременную трёхмерную визуализацию не менее двух наборов данных полученных оптическими методами с возможностью синхронной навигации, и средствами измерения (построение линейных гистограмм яркости и др.).
2. Визуальный инструмент Surface Renderer, позволяющий моделировать и визуализировать получаемые оптическими методами данные, получать модели объекта в виде изо-поверхности (iso-surface) и визуализировать их.
3. Визуальный инструмент SFP V olume rendering, позволяющий осуществлять трёхмерную визуализацию на основе алгоритма (Simulated Fluorescence Process, SFP).
4. Визуальный инструмент MIP projection или эквивалент, позволяющий получать минимальные, максимальные, средние проекции под любым углом с 3х и более мерных наборов данных.
5. Возможность рендеринга изображений для полиграфического качества постеров.

Дополнительно: сайт компании производителя http://www.svi.nl/HomePage

Программный пакет для деконволюции, визуализации и анализа изображений от SVI (получить пробную версию)
Huygens deconvolution, visualization and analysis software from SVI (free trial version)