Геномика

     Помимо секвенирования, в центре доступно оборудование для количественного ПЦР (qPCR) и генотипирования. Центр консультирует по выбору подходящей платформы и расходных материалов, также как и по всем аспектам от разработки экспериментального дизайна до анализа данных. Цифровая ПЦР (DD-PCR) лучшим образом подходит для поиска одиночных полиморфизмов (SNP) и количественного ПЦР. Микрофлуидная система высокопроизводительного ПЦР (Fluidigm) является инструментом выбора для проектов, включающих большое количество измерений генной экспрессии.
     Несмотря на бурное развитие направления исследований, отвечающего на вопросы «что?» и «как?» происходит в эксперименте, во многих случаях требуется отвечать на вопрос «где?» — уточнять локализацию описываемых изменений экспрессии генов. Особенно востребована такая задача в биологии развития и нейробиологии. Для реализации этого направления исследований доступна роботизированная платформа для проведения флуоресцентной in-situ гибридизации (FISH). Выделение микроучастков препарата для последующего анализа с максимальной чистотой возможно с использованием бесконтактного комплекса лазерной микродиссекции.
      Важной вехой бурного развития геномики явилась доступность вычислительных ресурсов и появления специализированного программного обеспечения для задач биоинформатики. Для обработки получаемых в ходе количественного ПЦР, высокопроизводительного ПЦР, секвенирования, данных, центр обеспечивает доступ к соответствующим вычислительным ресурсам и программному обеспечению. В случае недостатка имеющихся ресурсов для решения задач пользователи могут оформить заявку на использования оборудования ресурсного центра "Вычислительный центр" СПбГУ.