Roche/454 GS Junior

roche-gs-junior.jpg
Изображение с сайта www.gsjunior.com

      Пиросеквенатор Roche Junior GS

прибор может быть использован для:

  • De novo секвенирование микробных и вирусных геномов.
  • Целевое ресеквенирование интересующих областей генома.
  • Сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких мутаций.
  • Исследование метагеномов смешанных образцов из окружающей среды.
  • Секвенирование транскриптома.

Размещение: петергофская площадка

Статус: эксплуатация в режиме тестирования

Календарь занятости прибора

Основные технические характеристики

Производительность

Более 35 миллионов нуклеотидов за один запуск

Время запуска

10 часов – секвенирование

2 часа – первичная обработка данных

Длина прочтений

Средняя длина – 400 нуклеотидов

Точность

99% для 400 нуклеотидов

Количество прочтений за один запуск

100 000 прочтений

Принцип работы

Секвенирование с помощью прибора GS Junior включает в себя 4 этапа:
  1. Приготовление библиотеки.
  2. Эмульсионная ПЦР.
  3. Пиросеквенирование.
  4. Анализ результатов.

Методики

Методики

Требования к образцам

В качестве образца для секвенирования может выступать геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC. Из образца ДНК должна быть приготовлена библиотека, в которой секвенируемые фрагменты ДНК фланкированы участками для связывания универсальных праймеров для пиросеквенирования.

Дополнительные аксессуары

Дополнительный аксессуары
© Ресурсный центр развития молекулярных и клеточных технологий, СПбГУ, 2012, 2013